Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUFMP49411 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUFMP49411 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms