Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms