Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms