Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms