Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN2P35609 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms