Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms