Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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