Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms