Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD1P28340 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms