Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PLNP26678 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PLNP26678 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
PLNP26678 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
PLNP26678 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
PLNP26678 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PLNP26678 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms