Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB7P26010 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB7P26010 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms