Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO2P25791 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms