Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms