Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms