Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CCNA2P20248 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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