Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTPRAP18433 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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