Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms