Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFAPP14136 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms