Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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