Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms