Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DMDP11532 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DMDP11532 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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