Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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