Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms