Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms