Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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