Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms