Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms