Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASA4O43374 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms