Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LRRTM2O43300 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LRRTM2O43300 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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