Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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