Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms