Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms