Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms