Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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