Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms