Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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