Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SATB2Q9UPW6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms