Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms