Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTC7AQ9ULT0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms