Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms