Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIMS3Q9UJD0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms