Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms