Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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