Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms