Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms