Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms