Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms