Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8A2Q9NTI2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms