Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP35Q9NRY4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms