Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms